Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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PTPRNQ16849 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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PTPRNQ16849 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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PTPRNQ16849 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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PTPRNQ16849 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PTPRNQ16849 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PTPRNQ16849 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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