Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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ECM1Q16610 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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ECM1Q16610 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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ECM1Q16610 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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ECM1Q16610 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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ECM1Q16610 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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ECM1Q16610 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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ECM1Q16610 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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ECM1Q16610 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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ECM1Q16610 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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ECM1Q16610 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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ECM1Q16610 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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ECM1Q16610 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECM1Q16610 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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