Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms