Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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ZNHIT3Q15649 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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ZNHIT3Q15649 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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ZNHIT3Q15649 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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ZNHIT3Q15649 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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ZNHIT3Q15649 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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ZNHIT3Q15649 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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ZNHIT3Q15649 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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ZNHIT3Q15649 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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ZNHIT3Q15649 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZNHIT3Q15649 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZNHIT3Q15649 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZNHIT3Q15649 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNHIT3Q15649 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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