Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms