Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms