Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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