Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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