Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms