Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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