Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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