Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
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SHROOM2Q13796 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
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SHROOM2Q13796 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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