Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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NAE1Q13564 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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NAE1Q13564 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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NAE1Q13564 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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NAE1Q13564 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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