Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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TUBB3Q13509 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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TUBB3Q13509 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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