Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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