Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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MKRN3Q13064 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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