Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
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