Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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