Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
STX4Q12846 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms