Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms