Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms