Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms