Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TYRO3Q06418 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms