Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms