Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms