Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms