Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms