Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms