Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms