Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAE1P78406 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAE1P78406 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAE1P78406 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms