Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPL23P62829 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL23P62829 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms