Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms