Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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ACTBP60709 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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ACTBP60709 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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ACTBP60709 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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ACTBP60709 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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ACTBP60709 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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