Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms