Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NESP48681 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NESP48681 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NESP48681 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NESP48681 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NESP48681 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NESP48681 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NESP48681 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NESP48681 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NESP48681 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NESP48681 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NESP48681 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NESP48681 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NESP48681 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NESP48681 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NESP48681 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NESP48681 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NESP48681 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NESP48681 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NESP48681 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NESP48681 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NESP48681 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NESP48681 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NESP48681 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NESP48681 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NESP48681 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NESP48681 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NESP48681 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NESP48681 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NESP48681 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NESP48681 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NESP48681 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NESP48681 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NESP48681 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NESP48681 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NESP48681 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NESP48681 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NESP48681 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NESP48681 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NESP48681 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NESP48681 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NESP48681 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NESP48681 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NESP48681 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NESP48681 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NESP48681 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NESP48681 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NESP48681 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NESP48681 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NESP48681 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NESP48681 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NESP48681 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NESP48681 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NESP48681 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NESP48681 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NESP48681 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NESP48681 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NESP48681 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NESP48681 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NESP48681 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NESP48681 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NESP48681 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NESP48681 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms