Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ME1P48163 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ME1P48163 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ME1P48163 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ME1P48163 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ME1P48163 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ME1P48163 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ME1P48163 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms