Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRXP46100 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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