Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP2P42575 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP2P42575 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP2P42575 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP2P42575 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP2P42575 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP2P42575 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP2P42575 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP2P42575 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP2P42575 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP2P42575 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP2P42575 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP2P42575 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP2P42575 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP2P42575 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP2P42575 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP2P42575 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP2P42575 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP2P42575 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms