Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA3P42263 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms