Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms