Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms