Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB2P29033 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB2P29033 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB2P29033 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB2P29033 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB2P29033 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB2P29033 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB2P29033 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB2P29033 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB2P29033 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB2P29033 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms