Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms