Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PTPRBP23467 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PTPRBP23467 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PTPRBP23467 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PTPRBP23467 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PTPRBP23467 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PTPRBP23467 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PTPRBP23467 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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