Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms