Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms