Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DESP17661 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DESP17661 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DESP17661 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DESP17661 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DESP17661 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DESP17661 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DESP17661 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DESP17661 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DESP17661 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DESP17661 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DESP17661 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DESP17661 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DESP17661 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DESP17661 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DESP17661 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DESP17661 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms