Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRP12270 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TPRP12270 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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TPRP12270 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TPRP12270 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRP12270 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRP12270 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRP12270 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRP12270 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRP12270 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRP12270 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRP12270 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRP12270 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRP12270 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRP12270 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRP12270 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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