Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms