Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD4P09016 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD4P09016 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD4P09016 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD4P09016 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD4P09016 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD4P09016 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD4P09016 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD4P09016 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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